Acido 5-idrossindoleacetico del fluido cerebrospinale
Il 5-HT è un'indoleamina I neuroni dell'energia 5-HT sono concentrati principalmente nel gruppo del nucleo mesiale situato nella linea mediana del tronco encefalico, le cui fibre risalgono alla corteccia cerebrale, allo striato, al cervello ematico e all'ipotalamo. Fino all'area gliale, corna laterali e anteriori della materia grigia del midollo spinale. La sintesi di 5-HT è che il triptofano genera 5-idrossitriptofano (5-HTP) sotto l'azione del triptofano idrossilasi e quindi decarbossilati per produrre 5-HT sotto la catalisi della serotonina decarbossilasi. Sotto l'azione della monoamina ossidasi, il 5-HT viene degradato in acido acetico 5-i-droxyindole (5-HIAA).
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